More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3670 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
165 aa  337  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  93.94 
 
 
165 aa  320  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  85.96 
 
 
171 aa  297  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  82.94 
 
 
218 aa  288  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  82.35 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  82.35 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  84.12 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  82.35 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  82.35 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  82.94 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  82.35 
 
 
222 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  84.12 
 
 
174 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  82.35 
 
 
222 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  83.53 
 
 
174 aa  286  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  82.94 
 
 
174 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  82.94 
 
 
174 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  82.94 
 
 
174 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  82.63 
 
 
168 aa  283  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  82.63 
 
 
168 aa  283  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  67.88 
 
 
162 aa  239  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  68.29 
 
 
164 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  67.88 
 
 
162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  67.88 
 
 
162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  67.68 
 
 
163 aa  233  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  57.23 
 
 
157 aa  181  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  55.97 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  56.6 
 
 
161 aa  177  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  56.6 
 
 
161 aa  177  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  55.21 
 
 
188 aa  176  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  51.53 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  52.76 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  50.32 
 
 
156 aa  153  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  49.69 
 
 
161 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.12 
 
 
181 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.34 
 
 
153 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  46.95 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  52.17 
 
 
189 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 
175 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 
175 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.96 
 
 
152 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  45.68 
 
 
153 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
152 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
162 aa  141  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
152 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  46.79 
 
 
176 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
154 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
159 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
155 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
152 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
155 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
152 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
152 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
155 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
156 aa  140  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  46.06 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 
177 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.45 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
157 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.34 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.47 
 
 
156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 
157 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
154 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  44.85 
 
 
171 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 
162 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
171 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
160 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 
166 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
166 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.33 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  43.12 
 
 
164 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
161 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
156 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>