More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3741 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  97.52 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  97.52 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  96.89 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 162 aa  279  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  76.73 
 
 		 175 aa  257  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 175 aa  253  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  76.1 
 
 		 175 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  76.1 
 
 		 175 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  76.1 
 
 		 175 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 175 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  76.1 
 
 		 175 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  76.73 
 
 		 229 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 202 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  76.1 
 
 		 229 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 202 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 175 aa  247  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 213 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 169 aa  240  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  59.48 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 154 aa  180  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  57.89 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 164 aa  156  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50.33 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  48.03 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  45.45 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  45.45 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  45.64 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  46.41 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.23 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  45.75 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2709  AsnC family transcriptional regulator  71.59 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  47.02 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.76 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>