More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1877 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  69.54 
 
 		 155 aa  224  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 		 161 aa  221  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 158 aa  220  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  63.58 
 
 		 157 aa  206  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 		 161 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 		 161 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 		 172 aa  190  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  53.29 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  56.95 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  56.95 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  57.89 
 
 		 169 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  57.89 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  55.92 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  46.71 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  46.71 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  49.06 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 171 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.02 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.71 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.71 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.96 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.71 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.71 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 202 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  38.96 
 
 		 229 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 213 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.34 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.42 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  44.57 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  43.27 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  43.27 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>