More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02081 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 152 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  83.55 
 
 		 152 aa  271  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 152 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 152 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 152 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 177 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  81.46 
 
 		 152 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  80.92 
 
 		 152 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  80.92 
 
 		 152 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  80.92 
 
 		 152 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 154 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  71.05 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  71.05 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  71.05 
 
 		 155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  68.21 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 152 aa  207  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  65.33 
 
 		 155 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  62.67 
 
 		 155 aa  204  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 154 aa  197  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 154 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 181 aa  154  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 		 154 aa  153  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  47.13 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  47.13 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  46.05 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  46.5 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45.96 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  46.05 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  45.51 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  140  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  140  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 		 164 aa  140  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  43.71 
 
 		 167 aa  140  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.34 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  44.91 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.76 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  44.91 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  44.91 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  44.91 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  44.97 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>