More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0165 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 		 161 aa  247  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  74.34 
 
 		 169 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  71.9 
 
 		 157 aa  228  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 153 aa  213  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  62.09 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  64.24 
 
 		 161 aa  199  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  64.24 
 
 		 161 aa  199  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  63.58 
 
 		 172 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  62.25 
 
 		 163 aa  190  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  61.59 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  58.17 
 
 		 158 aa  186  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  60.26 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  60.26 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  60.26 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  50.33 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 		 166 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.42 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  45.51 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 202 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 213 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.76 
 
 		 229 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>