More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1230 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  73.58 
 
 		 162 aa  250  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  55.78 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  47.02 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  49.66 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  47.65 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  51.01 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  49.66 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  46.26 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  42.95 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  42.66 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.67 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  42.66 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  41.96 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 176 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  38.1 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 196 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  42.36 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  45.9 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>