More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0193 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
161 aa  322  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  78.43 
 
 
158 aa  249  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 
155 aa  247  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  74.83 
 
 
157 aa  235  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  73.68 
 
 
169 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  69.68 
 
 
161 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  69.68 
 
 
161 aa  222  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 
157 aa  221  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  65.61 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  64.71 
 
 
153 aa  207  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  62.75 
 
 
156 aa  202  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  62.03 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 
158 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 
158 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 
158 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 
158 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  64.47 
 
 
169 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  64.47 
 
 
159 aa  190  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  64.47 
 
 
159 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  62.5 
 
 
159 aa  190  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  62.34 
 
 
163 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  63.16 
 
 
159 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  57.79 
 
 
158 aa  185  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  61.84 
 
 
159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  56.29 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  52.32 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  51.66 
 
 
157 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
159 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
166 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
161 aa  160  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  51.97 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
166 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
166 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
166 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
162 aa  158  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
166 aa  157  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
162 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
213 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
162 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  48.7 
 
 
153 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  45.34 
 
 
175 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45 
 
 
175 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45 
 
 
175 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45 
 
 
175 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45 
 
 
175 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
202 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
202 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  44.38 
 
 
229 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
175 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  46.84 
 
 
162 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
162 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  46.2 
 
 
155 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.24 
 
 
175 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
159 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
156 aa  135  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  45.57 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  45.57 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  46.31 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 
164 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  45.57 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  46.2 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 
164 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  46.2 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 
164 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
165 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  45.57 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
152 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
154 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  45.64 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
156 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>