More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1709 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 172 aa  344  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  71.61 
 
 		 165 aa  235  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  62.66 
 
 		 169 aa  200  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  66.45 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 158 aa  200  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  62.66 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  63.58 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  64.1 
 
 		 159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  62.03 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 159 aa  193  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  60.51 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  60.9 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 153 aa  190  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 157 aa  190  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 157 aa  188  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  58.17 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  53.9 
 
 		 157 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  53.25 
 
 		 157 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  48.12 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 147 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  44.38 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 202 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.76 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  44.3 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  44.3 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  44.3 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  44.3 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  43.75 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 159 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 157 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  42.21 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 213 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  41.45 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 152 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.81 
 
 		 157 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 157 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  45.39 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>