More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4400 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  97.52 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 162 aa  279  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  76.1 
 
 		 175 aa  257  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  75.78 
 
 		 175 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  75.78 
 
 		 175 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  75.78 
 
 		 175 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  75.78 
 
 		 175 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  75.78 
 
 		 202 aa  254  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  76.73 
 
 		 229 aa  253  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  77.36 
 
 		 229 aa  253  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 175 aa  253  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  75.78 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 175 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 213 aa  243  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  73.75 
 
 		 169 aa  241  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  57.89 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  49.67 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  47.37 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  46.31 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.87 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  44.81 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.87 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  44.81 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  44.81 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  46.41 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 162 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2709  AsnC family transcriptional regulator  71.59 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  44.3 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  45.75 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.11 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>