More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2709 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2709  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  86.6 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  86.6 
 
 		 175 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  87.63 
 
 		 175 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  80.41 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  80.43 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  77.17 
 
 		 229 aa  147  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  78.49 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  75.27 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  75.27 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  75.27 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  75.27 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  75.27 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  76.09 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  75.27 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  74.16 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  71.59 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  71.59 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  71.59 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  71.59 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  67.9 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  67.9 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  65.48 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  63.53 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  53.09 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  41.75 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  41.75 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  48.72 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  48.72 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  51.28 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.22 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  45 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  45 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.28 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>