More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3685 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  350  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 153 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 		 152 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 159 aa  167  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  53.59 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  50.31 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  53.79 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 153 aa  151  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  50.98 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  50.98 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  53.79 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  51.03 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  52.41 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  47.33 
 
 		 152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 155 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50.33 
 
 		 153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 149 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 153 aa  144  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  52.24 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 156 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.67 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.67 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.67 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.02 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  46 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  44.81 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  44.93 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>