More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1173 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  315  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 
166 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  61.33 
 
 
153 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  62 
 
 
153 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 
154 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
154 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
156 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.94 
 
 
153 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
157 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
157 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
175 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  46.81 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
165 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 
169 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
159 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  47.52 
 
 
175 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  47.52 
 
 
175 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  47.52 
 
 
175 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  47.52 
 
 
175 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 
202 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
152 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  46.94 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  47.52 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
152 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
152 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  46.1 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
153 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
153 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  46.76 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  42.57 
 
 
169 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 
174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
155 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
155 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
155 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
157 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.04 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  45.07 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  45.07 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  45.07 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  46.72 
 
 
213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.1 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
181 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.96 
 
 
152 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
155 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  43.75 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
147 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
177 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
168 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
158 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>