More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2377 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  309  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  99.34 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  80.26 
 
 		 153 aa  257  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  77.63 
 
 		 153 aa  245  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  67.11 
 
 		 169 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 		 174 aa  177  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  51.39 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.39 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.74 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  46.31 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  47.92 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 176 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 161 aa  136  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 213 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.08 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.08 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.08 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 175 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.71 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.71 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.59 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  41.92 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  41.92 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  45.03 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 161 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  44 
 
 		 175 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  41.06 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  44 
 
 		 229 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>