More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2780 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  298  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 153 aa  199  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  46.62 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.57 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.71 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  40.54 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  40.54 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  41.22 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  41.22 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  41.22 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  37.74 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  39.86 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  36.24 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  39.1 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.91 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  37.42 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>