More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3419 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  57.62 
 
 		 156 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 153 aa  186  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  42.96 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  43.79 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  43.14 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  43.71 
 
 		 229 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  42.25 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.48 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.38 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.38 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 166 aa  125  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.38 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.38 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 202 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  43.79 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.38 
 
 		 229 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 174 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.17 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
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NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  42.17 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  42.17 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
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