More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3311 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  86.21 
 
 		 175 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  85.63 
 
 		 175 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  87.36 
 
 		 175 aa  316  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  83.91 
 
 		 175 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  83.91 
 
 		 175 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  83.91 
 
 		 202 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  83.91 
 
 		 175 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  83.91 
 
 		 175 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  83.91 
 
 		 229 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 202 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  83.91 
 
 		 229 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  86.39 
 
 		 169 aa  290  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  81.21 
 
 		 213 aa  276  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 162 aa  255  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 161 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  75.47 
 
 		 161 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 161 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 161 aa  247  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 156 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 154 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 155 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  55.26 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2709  AsnC family transcriptional regulator  80.41 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 159 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 		 156 aa  147  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  46.36 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  46.05 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  39.49 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  45.39 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  46.05 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  46.05 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  48 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  45.16 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  47.33 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>