More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2879 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  327  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  94.97 
 
 		 170 aa  313  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  92.36 
 
 		 159 aa  303  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  91.72 
 
 		 158 aa  298  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 160 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  90.38 
 
 		 160 aa  293  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  89.74 
 
 		 176 aa  290  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  64.47 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 161 aa  197  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 166 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 166 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  63.82 
 
 		 166 aa  193  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  63.82 
 
 		 166 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  61.29 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 157 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  58.82 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  59.86 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  59.86 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  55.94 
 
 		 175 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  55.94 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  52.67 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 170 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45.1 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45.1 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45.1 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45.1 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 202 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 202 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.1 
 
 		 229 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  43.14 
 
 		 229 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  40.4 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.67 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  46.71 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  46.71 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  46.71 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  43.71 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>