More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3138 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  100 
 
 		 155 aa  320  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  82.58 
 
 		 155 aa  276  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  83.01 
 
 		 175 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  70.78 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  70.75 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  70.75 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 161 aa  187  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  59.46 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 180 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  56.64 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 176 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  55.94 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  52.67 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  51.77 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.14 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 154 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.45 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 177 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.06 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.06 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.06 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  40.56 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 181 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  37.76 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  39.87 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.16 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>