More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3216 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  96.93 
 
 		 164 aa  322  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  86.88 
 
 		 162 aa  292  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  85.62 
 
 		 162 aa  287  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  85.62 
 
 		 162 aa  287  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  69.51 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  67.06 
 
 		 218 aa  235  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  67.68 
 
 		 165 aa  233  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  66.47 
 
 		 171 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  66.47 
 
 		 171 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  66.47 
 
 		 171 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  66.47 
 
 		 171 aa  233  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 171 aa  233  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  66.47 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 171 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 174 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  66.47 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  66.47 
 
 		 168 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 174 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  62.57 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 157 aa  190  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  59.35 
 
 		 157 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 188 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  49.06 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.86 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  46.84 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  45.57 
 
 		 189 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 175 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 175 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 175 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 175 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 177 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 202 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  43.04 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.31 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 		 175 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.04 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.41 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  44.1 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  39.1 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  40.99 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>