More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0896 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  97.01 
 
 
167 aa  338  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  317  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  317  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  317  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
166 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  85.53 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  83.44 
 
 
171 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  82.42 
 
 
167 aa  286  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  65.77 
 
 
175 aa  210  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  61.88 
 
 
162 aa  210  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  65.77 
 
 
175 aa  210  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  65.1 
 
 
176 aa  209  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  61.54 
 
 
159 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  63.64 
 
 
158 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  62.24 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  54.48 
 
 
174 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  54.48 
 
 
174 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  54.48 
 
 
174 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  52.23 
 
 
174 aa  167  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  53.57 
 
 
153 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
165 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.36 
 
 
162 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.36 
 
 
162 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  43.53 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  43.53 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  43.53 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
218 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  43.53 
 
 
171 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  41.36 
 
 
162 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 
222 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  43.71 
 
 
168 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  43.53 
 
 
222 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  43.71 
 
 
168 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 
157 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
157 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
171 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  44.24 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  44.24 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  44.24 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
181 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.76 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  131  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  44.74 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
177 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.99 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 
155 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.13 
 
 
152 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
158 aa  123  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
159 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
200 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
157 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.11 
 
 
152 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
169 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
200 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 
157 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>