More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  100 
 
 
158 aa  316  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  98.1 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  68.87 
 
 
162 aa  215  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  67.53 
 
 
159 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  64.14 
 
 
175 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  64.14 
 
 
175 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  62.76 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  65.52 
 
 
171 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  65.52 
 
 
171 aa  190  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  55.48 
 
 
174 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  55.48 
 
 
174 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  54.84 
 
 
174 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  64.34 
 
 
167 aa  187  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  64.34 
 
 
167 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 
174 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  57.82 
 
 
153 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  63.64 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
166 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
166 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
166 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
166 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
166 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 
166 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  60.53 
 
 
166 aa  183  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
153 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
165 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  45.28 
 
 
171 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  43.75 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  43.75 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
155 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
157 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 
162 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 
157 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 
162 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
160 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  43.67 
 
 
171 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  43.67 
 
 
171 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  43.67 
 
 
171 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  43.67 
 
 
171 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  43.67 
 
 
222 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
158 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
157 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
222 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
159 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 
171 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
175 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  40.56 
 
 
155 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
161 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  41.89 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
181 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  47.26 
 
 
189 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
174 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
165 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
152 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
156 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
156 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
174 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
174 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
174 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
174 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  40 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.69 
 
 
152 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
162 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
156 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
159 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
164 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 
156 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 
156 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
151 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
151 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>