More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0033 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  70.44 
 
 		 189 aa  208  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  48.43 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  48.43 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  47.8 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  49.69 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 218 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  48.5 
 
 		 222 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  48.5 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 222 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  48.5 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  48.5 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  48.5 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  47.9 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  47.9 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  45.21 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  46.21 
 
 		 176 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  42.04 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  43.59 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 171 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 181 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 166 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>