More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5672 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  316  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 157 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  83.87 
 
 		 157 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 158 aa  173  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  59.33 
 
 		 157 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  59.33 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  53.29 
 
 		 161 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  50.66 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  48.03 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 165 aa  147  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  47.71 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  47.33 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  48.68 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.76 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.31 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  47.37 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  47.1 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  47.37 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  47.37 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  47.1 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  42.58 
 
 		 169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  46.45 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.45 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.1 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.16 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>