More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1965 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  98.19 
 
 
166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  92.22 
 
 
167 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  89.22 
 
 
167 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  84.34 
 
 
171 aa  292  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  83.95 
 
 
171 aa  291  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  82.93 
 
 
167 aa  287  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  64.67 
 
 
176 aa  210  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 
175 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 
175 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  64.19 
 
 
162 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 
159 aa  203  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  61.33 
 
 
158 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  54.09 
 
 
174 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  54.09 
 
 
174 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  54.09 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  53.5 
 
 
174 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
157 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 
162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  43.9 
 
 
165 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 
162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.62 
 
 
162 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
165 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.76 
 
 
155 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  41.76 
 
 
171 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  41.76 
 
 
171 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  41.76 
 
 
171 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  41.76 
 
 
171 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
181 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
171 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  42.35 
 
 
218 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
174 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
222 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  41.76 
 
 
222 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
159 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.42 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
154 aa  130  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  39.75 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
159 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 
154 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40 
 
 
152 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
153 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
157 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  43.23 
 
 
157 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.79 
 
 
152 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
157 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
155 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  42.76 
 
 
156 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  42.76 
 
 
156 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
168 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  45.45 
 
 
189 aa  120  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>