More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5614 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  329  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  72.84 
 
 
164 aa  246  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  53.5 
 
 
175 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  52.87 
 
 
175 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  54.78 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  52.87 
 
 
175 aa  176  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  55.41 
 
 
175 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  55.41 
 
 
175 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  55.41 
 
 
175 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 
162 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  55.41 
 
 
175 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 
202 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  55.41 
 
 
229 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 
202 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  54.78 
 
 
229 aa  173  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 
161 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 
161 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  54.67 
 
 
161 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 
161 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  53.12 
 
 
169 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 
156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 
154 aa  163  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  55.24 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 
153 aa  160  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  50.63 
 
 
164 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  50.63 
 
 
164 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
156 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
156 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
157 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
156 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  46.05 
 
 
156 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 
155 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
155 aa  153  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
153 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
153 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
155 aa  150  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
156 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 
154 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 
154 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
158 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
157 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
155 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  50.33 
 
 
157 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
157 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.33 
 
 
156 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
174 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
160 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  50.65 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  50.65 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  47.92 
 
 
155 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  43.71 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
165 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  47.22 
 
 
155 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 
147 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
156 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 
161 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
198 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
168 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.79 
 
 
163 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
198 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
157 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 
161 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
153 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48 
 
 
153 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
168 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
162 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
159 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
181 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
153 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
282 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  48.7 
 
 
159 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
155 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
155 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  45.1 
 
 
162 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 
168 aa  141  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
198 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  41.25 
 
 
172 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
159 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
157 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
154 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 
156 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>