More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2784 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  98.28 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  97.7 
 
 		 174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  97.66 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  93.68 
 
 		 218 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  92.4 
 
 		 171 aa  327  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  92.4 
 
 		 171 aa  327  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  92.4 
 
 		 171 aa  327  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  92.4 
 
 		 171 aa  327  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  92.4 
 
 		 222 aa  326  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  92.4 
 
 		 222 aa  326  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  91.81 
 
 		 171 aa  324  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  93.41 
 
 		 168 aa  323  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  93.41 
 
 		 168 aa  323  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 		 171 aa  291  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  82.94 
 
 		 165 aa  285  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  82.94 
 
 		 165 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 163 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  63.53 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  63.53 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  63.53 
 
 		 162 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  57.58 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  56.97 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  56.97 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  55.62 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 156 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  48.12 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  48.12 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  47.93 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  47.5 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 152 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 152 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 152 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.78 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.42 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 152 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  43.45 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  42.26 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  42.53 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 154 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 175 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.78 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 167 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  49.7 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  40.61 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  40.83 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.96 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  42.26 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  41.07 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  42.26 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  40.96 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>