More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4188 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  94.19 
 
 
161 aa  300  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  94.19 
 
 
161 aa  300  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  85.62 
 
 
160 aa  290  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  88.31 
 
 
157 aa  283  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  86.54 
 
 
157 aa  283  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  74.38 
 
 
160 aa  245  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  59.35 
 
 
162 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  59.35 
 
 
162 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  59.35 
 
 
162 aa  188  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
164 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  57.06 
 
 
165 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  55.21 
 
 
165 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  55.62 
 
 
174 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  55.62 
 
 
174 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  55.62 
 
 
174 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  55.76 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  55.76 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  51.89 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  51.89 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  55.76 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  55.03 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  55.03 
 
 
174 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  55.03 
 
 
171 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  55.15 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  53.01 
 
 
171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.43 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
154 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 
155 aa  131  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  45.62 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  41.61 
 
 
158 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
153 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
161 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  46.1 
 
 
152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.86 
 
 
152 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40.94 
 
 
229 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
168 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
154 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
154 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  46.45 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  45.86 
 
 
152 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  45.86 
 
 
152 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
154 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  42.94 
 
 
166 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
157 aa  125  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  40.26 
 
 
163 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  45.86 
 
 
152 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  42.94 
 
 
166 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 
154 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  42.94 
 
 
166 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  42.94 
 
 
166 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
154 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
166 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
166 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
177 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
163 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
152 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
162 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.77 
 
 
229 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.77 
 
 
202 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
156 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  41.67 
 
 
155 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  39.77 
 
 
202 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
157 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  39.61 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  39.61 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>