More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1480 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 156 aa  224  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 155 aa  213  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  64.71 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 169 aa  197  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  57.89 
 
 		 172 aa  190  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 165 aa  188  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  60.53 
 
 		 161 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  60.53 
 
 		 161 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  56.21 
 
 		 158 aa  186  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  58.55 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  58.55 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  55.92 
 
 		 163 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  55.92 
 
 		 159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  50.33 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  49.67 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  50.66 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  45.68 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  46.36 
 
 		 229 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45.7 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45.7 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45.7 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45.7 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 202 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.7 
 
 		 229 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 202 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  46.2 
 
 		 162 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 213 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  42.86 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44.94 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  42.86 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44.94 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 174 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  42.26 
 
 		 222 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 222 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  43.14 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  43.14 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  43.14 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  42.26 
 
 		 171 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  42.26 
 
 		 171 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  42.26 
 
 		 171 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  42.26 
 
 		 171 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>