More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03286 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  70.44 
 
 
161 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 
165 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  51.19 
 
 
171 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  50.93 
 
 
165 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 
166 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  48.43 
 
 
162 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  47.13 
 
 
162 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  48.43 
 
 
162 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  49.7 
 
 
218 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
222 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  46.41 
 
 
222 aa  148  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  50.3 
 
 
174 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  50.3 
 
 
171 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  47.31 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  47.31 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  47.31 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  49.7 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  47.31 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  47.31 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  47.31 
 
 
168 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  49.7 
 
 
174 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  49.7 
 
 
174 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  47.31 
 
 
168 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  49.7 
 
 
174 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
164 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  45.91 
 
 
166 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
163 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  45.91 
 
 
166 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  45.91 
 
 
166 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  45.91 
 
 
166 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  45.91 
 
 
166 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 
157 aa  140  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  48.98 
 
 
176 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46.79 
 
 
157 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 
157 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
162 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  46.45 
 
 
157 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
156 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 
175 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 
175 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  46.79 
 
 
157 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
171 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
160 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
157 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
159 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
154 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
153 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
156 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
167 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  47.26 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
162 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.91 
 
 
161 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.45 
 
 
156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>