More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0777 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 175 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 175 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  93.1 
 
 		 176 aa  327  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 162 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  70.44 
 
 		 159 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 171 aa  210  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  61.64 
 
 		 171 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  65.1 
 
 		 167 aa  208  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 158 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  64.14 
 
 		 158 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  56.95 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 153 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  48.45 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  48.45 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  47.83 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  47.83 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  47.83 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 222 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  47.83 
 
 		 222 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 218 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 174 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 171 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  41.72 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.38 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  44.22 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  42.07 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  47.62 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 163 aa  121  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>