More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2311 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 166 aa  249  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  76.1 
 
 		 166 aa  248  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 166 aa  247  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  73.12 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 166 aa  243  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  69.28 
 
 		 155 aa  225  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  69.43 
 
 		 157 aa  224  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 164 aa  220  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  63.76 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  63.76 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  64.47 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  60.65 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 157 aa  187  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  58.71 
 
 		 155 aa  187  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  60.78 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  60.93 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 168 aa  176  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.67 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  44.83 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  43.71 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 213 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.36 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  41.03 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.03 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>