More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4045 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
159 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 
158 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 
160 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 
176 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  47.22 
 
 
160 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
180 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
161 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 
166 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  45.39 
 
 
166 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
166 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
166 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  42.58 
 
 
156 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  42.58 
 
 
156 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
156 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
153 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
156 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  50.44 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
158 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
156 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
155 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
174 aa  111  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  43.06 
 
 
170 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
157 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.13 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  47.79 
 
 
155 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
174 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 
159 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  44.12 
 
 
156 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 
157 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
156 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
157 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
153 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
154 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
154 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
174 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
174 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 
161 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
154 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
154 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  41.14 
 
 
161 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
150 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
156 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
154 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
158 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
153 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
150 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
154 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
181 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
172 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
154 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.41 
 
 
159 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 
154 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
196 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.47 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  39.33 
 
 
169 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  40 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  37.09 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
157 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
157 aa  98.2  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
162 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>