More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5171 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 		 154 aa  299  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  95.45 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 174 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 174 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 154 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 174 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  80.26 
 
 		 155 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  79.61 
 
 		 155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  79.08 
 
 		 154 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  47.68 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 160 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  47.68 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 162 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  44 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  44 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.48 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 181 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.06 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>