More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4647 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  320  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  89.1 
 
 
168 aa  287  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  89.1 
 
 
168 aa  287  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  82.69 
 
 
167 aa  269  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  82.05 
 
 
188 aa  266  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  79.75 
 
 
163 aa  265  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  79.49 
 
 
158 aa  259  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  69.03 
 
 
197 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  70.13 
 
 
186 aa  224  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
161 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
159 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
159 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.39 
 
 
159 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
157 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 
159 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
181 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 
159 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
157 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
157 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
153 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
154 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  49.04 
 
 
154 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
159 aa  141  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
155 aa  137  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
156 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
155 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  43.67 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 
156 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
154 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
158 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
158 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
158 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
158 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  41.14 
 
 
159 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  41.14 
 
 
169 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  130  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  40.67 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 
159 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
156 aa  127  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
160 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
166 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  41.33 
 
 
160 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.61 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 
166 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
158 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
159 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
174 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
174 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
162 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
162 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 
156 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
202 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
174 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  41.25 
 
 
165 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
157 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
202 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 
229 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 
154 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.83 
 
 
229 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 
164 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
172 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.25 
 
 
165 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
154 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
154 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>