More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3904 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  72.33 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  72.26 
 
 		 168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  71.9 
 
 		 163 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  66.87 
 
 		 188 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  71.61 
 
 		 158 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 158 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 167 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  50.98 
 
 		 157 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 157 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 153 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 158 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 158 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 158 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 158 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 159 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 159 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.94 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  45.22 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  45.22 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  45.81 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  39.35 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 156 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  121  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 157 aa  121  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  38 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 156 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 153 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>