More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1974 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  73.03 
 
 		 157 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 156 aa  219  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  66.89 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  65.79 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  65.56 
 
 		 156 aa  215  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  63.82 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  64.24 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  64.67 
 
 		 157 aa  213  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 159 aa  173  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  54.67 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  54 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  45.75 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 163 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 166 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 164 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.14 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  43.33 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  44 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 169 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 180 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.01 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  42.67 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>