More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6537 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  45.51 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.05 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  42.48 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  45.33 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.38 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  41.86 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  44.19 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  41.86 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.86 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 169 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 180 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2310  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  35.33 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.4 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  43.97 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 198 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 282 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>