More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1869 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  316  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  60.43 
 
 
159 aa  188  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  51.33 
 
 
157 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  52.32 
 
 
156 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 
156 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
155 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  51.33 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 
156 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  52.32 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  51.66 
 
 
156 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
156 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 
157 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
156 aa  144  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
158 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.79 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
150 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
169 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
169 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
158 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
165 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
152 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
153 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
160 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
162 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  37.75 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
158 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
198 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
198 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
172 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  41.56 
 
 
169 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
282 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
168 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
160 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
155 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
172 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
153 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38 
 
 
152 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
153 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.84 
 
 
153 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
168 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  31.79 
 
 
156 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 
153 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  34.67 
 
 
151 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
154 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
157 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>