More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2413 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  323  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 156 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  47.4 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  43.51 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.67 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  43.51 
 
 		 157 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.86 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.25 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  40.4 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.41 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 150 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 198 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 181 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 282 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 198 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 198 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  37.09 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2759  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.502545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2505  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.14 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>