More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1868 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 156 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  53.33 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  54 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  48.34 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  52.67 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.67 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 155 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  40.4 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.33 
 
 		 152 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  40.79 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.67 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.67 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.67 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.67 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.67 
 
 		 229 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.33 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  33.77 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>