More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3156 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  317  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  98.71 
 
 
155 aa  313  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  78.06 
 
 
159 aa  258  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 
158 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  56.49 
 
 
156 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  56.49 
 
 
156 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  56.49 
 
 
156 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  56.49 
 
 
156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  55.19 
 
 
159 aa  184  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 
156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  53.25 
 
 
157 aa  176  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  53.25 
 
 
157 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 
156 aa  170  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 
157 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  53.06 
 
 
165 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
166 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
159 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
159 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
166 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
171 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
169 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
169 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 
163 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
159 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  50.68 
 
 
166 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 
162 aa  146  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  45.27 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 
162 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
155 aa  144  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
169 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 
162 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
169 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.7 
 
 
169 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  48.95 
 
 
167 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
169 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  48.95 
 
 
167 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
180 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
150 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  48.95 
 
 
167 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
154 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
169 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 
159 aa  140  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
164 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 
152 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
153 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
157 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
159 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
154 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  41.45 
 
 
155 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
177 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  45.27 
 
 
159 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
171 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  42.67 
 
 
156 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
152 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
158 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
153 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 
162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  43.33 
 
 
151 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
152 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 
162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
155 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
160 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
150 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
198 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
282 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
168 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
198 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
168 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
153 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  42.21 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.41 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  40.79 
 
 
154 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
164 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 
158 aa  133  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>