More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3319 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 153 aa  222  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  53.59 
 
 		 158 aa  193  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 150 aa  188  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  57.55 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  47.59 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 172 aa  150  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  47.71 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  44 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  37.25 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  37.25 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  41.33 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  38 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  38 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  36.18 
 
 		 229 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  38.56 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  38.56 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  43.05 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  38.16 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.33 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  39.74 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 178 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  38.96 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  35.67 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  42.38 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>