More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6217 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  53.59 
 
 		 156 aa  183  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  52.32 
 
 		 229 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 		 175 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  50.99 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  50.99 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  50.99 
 
 		 229 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  50.99 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  50.99 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 202 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 175 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 175 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  50 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 154 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 213 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  50.33 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 177 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  46.05 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  44.74 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  45.39 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.08 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  43.14 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  44.74 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  44.74 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  44.74 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  44.74 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  44 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  44 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>