More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2877 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  78.71 
 
 		 155 aa  259  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  78.06 
 
 		 155 aa  258  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 158 aa  193  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  53.9 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 156 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  52.6 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  53.9 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  52.26 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 156 aa  173  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  50.65 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  50.65 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  45.95 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.85 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  42.95 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  44.37 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.05 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 198 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 198 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 198 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 282 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  42 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 169 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  41.56 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  45.75 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  44.44 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.7 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>