More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0985 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 156 aa  246  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  73.38 
 
 		 156 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  73.38 
 
 		 159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  73.38 
 
 		 156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 155 aa  234  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  69.23 
 
 		 157 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  73.03 
 
 		 156 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  68.59 
 
 		 157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  53.9 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  53.25 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 162 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 198 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 168 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 282 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 198 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 198 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.7 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.1 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  41.83 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  42 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>