More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1307 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  328  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  328  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  98.11 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  97.48 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  46.45 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  49.02 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.44 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 188 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 181 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 176 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>