More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3085 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  306  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  306  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  306  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 
154 aa  298  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 
154 aa  298  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  96.1 
 
 
154 aa  298  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  95.45 
 
 
154 aa  296  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  84.42 
 
 
174 aa  266  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 
174 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 
174 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 
154 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 
154 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 
154 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  83.77 
 
 
154 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  80.79 
 
 
155 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  80.13 
 
 
155 aa  249  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  79.08 
 
 
154 aa  249  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 
153 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 
154 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
159 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
159 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  49.02 
 
 
160 aa  150  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 
154 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
160 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
159 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 
161 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 
162 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
162 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
162 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
158 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
154 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.33 
 
 
159 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  43.33 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
153 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 
153 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  43.33 
 
 
160 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.14 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
156 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
188 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
158 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
152 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
153 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
155 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42 
 
 
155 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
155 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.45 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
155 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 
158 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
152 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
155 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
154 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
154 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 
153 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
158 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
157 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
158 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
152 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
161 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
153 aa  120  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
154 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 
158 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
152 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>