More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5103 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  95 
 
 		 162 aa  316  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  63.12 
 
 		 160 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  39.47 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.05 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.82 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  37.91 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4523  transcriptional regulator, AsnC family  40.29 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 158 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 186 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  40.37 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>