More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4523 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4523  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 143 aa  292  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 174 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 174 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  37.69 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.59 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2046  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 171 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 173 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  33.8 
 
 		 229 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 152 aa  96.7  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>