More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7223 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  97.44 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 160 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 160 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 160 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 160 aa  264  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 160 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 160 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  80.92 
 
 		 160 aa  262  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 168 aa  186  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  45.45 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  45.45 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  41.33 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  41.1 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  40.67 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  41.26 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  44.06 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  39.61 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  40.41 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  40.41 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  39.47 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.15 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  39.33 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  43.15 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>